MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_4p

Total Repeats: 754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012725	CGC	2	6	1921	1926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_012725	GC	3	6	1968	1973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012725	GGC	2	6	1983	1988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012725	AT	3	6	2042	2047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012725	TGG	2	6	2151	2156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012725	CATCG	2	10	2230	2239	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_012725	ACGCAT	2	12	2292	2303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012725	AAG	2	6	2423	2428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012725	CTTC	2	8	2438	2445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012725	GCAA	2	8	2490	2497	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012725	TCT	2	6	2564	2569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012725	CTC	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_012725	TAAG	2	8	2644	2651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012725	AAAGC	2	10	2661	2670	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012725	T	8	8	2680	2687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012725	GCC	2	6	2736	2741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_012725	GAGC	2	8	2920	2927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012725	ACC	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_012725	CCTC	2	8	3955	3962	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_012725	CAGC	2	8	4028	4035	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012725	CTG	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012725	C	6	6	4518	4523	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_012725	C	6	6	4589	4594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_012725	GCG	2	6	4620	4625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012725	TGT	2	6	4627	4632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012725	TGA	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012725	CGG	2	6	4698	4703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012725	GC	3	6	4734	4739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012725	CG	4	8	4743	4750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012725	TGC	2	6	4770	4775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012725	GCC	2	6	4777	4782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_012725	GCG	2	6	4808	4813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012725	CCG	2	6	4821	4826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_012725	GCG	2	6	4856	4861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012725	ATG	2	6	4888	4893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012725	TCA	2	6	4906	4911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012725	AGGGG	2	10	4918	4927	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012725	ATG	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012725	GTG	2	6	6055	6060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012725	CCG	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012725	CG	3	6	6149	6154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012725	TCA	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012725	TC	3	6	6219	6224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012725	GCAAC	2	10	6234	6243	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_012725	C	6	6	6269	6274	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_012725	GCT	2	6	6284	6289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012725	ACC	2	6	6308	6313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_012725	CGCC	2	8	6331	6338	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_012725	GGA	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012725	TTCG	2	8	6430	6437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012725	GCCC	2	8	6445	6452	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_012725	TAGA	2	8	6484	6491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012725	CCCGAC	2	12	6527	6538	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012725	GCCT	2	8	6576	6583	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012725	CAGC	2	8	6647	6654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012725	GC	3	6	7631	7636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012725	GCG	2	6	7707	7712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012725	GT	3	6	7781	7786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012725	GTCA	2	8	7791	7798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012725	CA	3	6	7807	7812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012725	GGC	2	6	7869	7874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012725	T	10	10	7928	7937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012725	TC	4	8	7946	7953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012725	CCT	2	6	7955	7960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_012725	CAA	2	6	7975	7980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012725	TTCCAG	2	12	8016	8027	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012725	CCTG	2	8	15214	15221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012725	CG	3	6	15262	15267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012725	C	6	6	15280	15285	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_012725	TCC	2	6	15293	15298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012725	GGT	2	6	15320	15325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012725	CGC	2	6	16790	16795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_012725	GCA	2	6	16805	16810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012725	AGAT	2	8	16825	16832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012725	GCA	2	6	16844	16849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012725	CTGT	2	8	16874	16881	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012725	TTC	2	6	16966	16971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012725	ATCG	2	8	16972	16979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012725	GCAC	2	8	17026	17033	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012725	GGCT	2	8	17034	17041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012725	AGC	2	6	17131	17136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012725	GGT	2	6	17235	17240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012725	CCG	2	6	17274	17279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012725	GC	3	6	17310	17315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012725	TGC	2	6	17770	17775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012725	TGA	2	6	20581	20586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012725	GGGC	2	8	20589	20596	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012725	CAC	2	6	21280	21285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_012725	CA	3	6	21344	21349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012725	CGG	2	6	21368	21373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012725	AAT	2	6	21465	21470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012725	GC	3	6	28717	28722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012725	GCA	2	6	28735	28740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012725	GTA	2	6	28901	28906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012725	GCG	2	6	28932	28937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012725	CGG	2	6	28985	28990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012725	ACC	2	6	29010	29015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_012725	CGG	2	6	29065	29070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012725	TG	3	6	29088	29093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012725	GCG	2	6	29121	29126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012725	GC	3	6	29143	29148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012725	GACC	2	8	29212	29219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012725	TGAT	2	8	35053	35060	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012725	TGA	2	6	40803	40808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012725	GTG	2	6	40914	40919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012725	TGCGG	2	10	40924	40933	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_012725	TCC	2	6	42011	42016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_012725	GGC	2	6	42076	42081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012725	CG	3	6	46553	46558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012725	GGC	2	6	46608	46613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012725	CTTA	2	8	46682	46689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012725	TCC	2	6	46696	46701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_012725	CGG	2	6	47647	47652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012725	CGA	2	6	47685	47690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012725	TGCGC	2	10	47724	47733	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_012725	GCC	2	6	47742	47747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_012725	GA	4	8	47790	47797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012725	GA	3	6	47810	47815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012725	GC	3	6	47874	47879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012725	CAC	2	6	47942	47947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_012725	GGAC	2	8	47981	47988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012725	TC	4	8	48045	48052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012725	GCCG	2	8	48110	48117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012725	CTG	2	6	48146	48151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012725	GTT	2	6	48158	48163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012725	TC	3	6	48243	48248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012725	GC	3	6	48259	48264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012725	CT	3	6	48265	48270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012725	CTT	2	6	48290	48295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012725	GTC	2	6	48296	48301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012725	CA	3	6	48324	48329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012725	TTCC	2	8	48434	48441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012725	TCGT	2	8	48535	48542	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012725	CAC	2	6	48577	48582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_012725	ATC	2	6	48583	48588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012725	TTCG	2	8	48589	48596	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012725	AGAC	2	8	48614	48621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012725	ACA	2	6	49143	49148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012725	GAA	2	6	49294	49299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012725	AGA	2	6	49300	49305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012725	GA	3	6	49377	49382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012725	CGA	2	6	49387	49392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012725	AAG	2	6	49401	49406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012725	AC	3	6	49583	49588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012725	AAC	2	6	49690	49695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012725	GAC	2	6	49726	49731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_012725	GC	3	6	50571	50576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012725	AAG	2	6	50582	50587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012725	TAGG	2	8	50617	50624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_012725	TAG	2	6	50693	50698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012725	CGA	2	6	50725	50730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_012725	CGTT	2	8	51371	51378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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291	NC_012725	GC	3	6	73948	73953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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294	NC_012725	CGG	2	6	74091	74096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_012725	CGGC	2	8	74156	74163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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421	NC_012725	GC	3	6	98320	98325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
422	NC_012725	CCA	2	6	98326	98331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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430	NC_012725	ATG	2	6	104381	104386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_012725	CAG	2	6	108516	108521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_012725	GCC	2	6	108547	108552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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436	NC_012725	CG	3	6	109501	109506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
437	NC_012725	GAA	2	6	109520	109525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
438	NC_012725	GAA	2	6	109556	109561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_012725	CGC	2	6	109640	109645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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441	NC_012725	CGC	2	6	109734	109739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
442	NC_012725	GCG	2	6	109763	109768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_012725	CG	3	6	109804	109809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
444	NC_012725	CAC	2	6	109832	109837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
445	NC_012725	GCA	2	6	109842	109847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_012725	GGCGC	2	10	113844	113853	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
452	NC_012725	ATT	2	6	116430	116435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_012725	GCG	2	6	116678	116683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_012725	GCG	2	6	116717	116722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_012725	CTT	2	6	117697	117702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_012725	TTG	2	6	117784	117789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
464	NC_012725	CG	3	6	117835	117840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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470	NC_012725	TGG	2	6	118065	118070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
471	NC_012725	TCG	2	6	118133	118138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
472	NC_012725	ACA	2	6	118160	118165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_012725	CGCC	2	8	118204	118211	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
474	NC_012725	CAG	2	6	118216	118221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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480	NC_012725	GTCCTG	2	12	118549	118560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
481	NC_012725	GTG	2	6	118603	118608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
482	NC_012725	CCCG	2	8	118612	118619	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
483	NC_012725	CTA	2	6	118667	118672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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492	NC_012725	CG	3	6	118901	118906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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497	NC_012725	CCTT	2	8	119192	119199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
498	NC_012725	CGG	2	6	119225	119230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_012725	GGC	2	6	119274	119279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_012725	GAA	2	6	119285	119290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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